ניר קברטי נמנה כיום על השורה הראשונה של המנצחים הצעירים הישראלים, הפועלים בארץ ובחו"ל, וזוכה למוניטין בינלאומי רב הן בתחום הסימפוני והן בתחום האופרה. בשנת 2006 נבחר מתוך כ-300 מועמדים למשרת המנהל המוסיקאלי של התזמורת הסימפונית של סנטה ברברה, קליפורניה. לצד לימודי פסנתר באקדמיה למוסיקה ע"ש רובין בתל-אביב למד ניצוח באופן פרטי אצל המלחין והמנצח פרופ' נועם שריף, ולאחר מכן השלים תואר שני בניצוח בבית הספר הגבוה למוסיקה בוינה.
באוסטריה קיבל את משרתו הראשונה כפסנתרן ומנצח מקהלת בית האופרה הממלכתי של וינה. בשנת 2000 התמנה לתפקיד עוזר המנהל המוסיקלי בתאטרון המלכותי של ספרד במדריד, והחל בשיתוף פעולה הדוק עם בית האופרה של פירנצה, מאג'ו מוסיקלה פיורנטינו, שם כיהן בתפקיד מנצח הבית ועוזרו האישי של המנהל המוסיקלי, מאסטרו זובין מהטה.
ניר קברטי ניצח על התזמורת הפילהרמונית הישראלית, התזמורת הפילהרמונית של טוקיו, התזמורת הפילהרמונית של תאטרון קולון (בואנוס איירס), התזמורת הפילהרמונית של זגרב, התזמורת הפילהרמונית של האיים הקנארים, התזמורת הסימפונית של מדריד, התזמורת הסימפונית הישראלית ראשון לציון, התזמורת הסימפונית ירושלים רשות השידור, התזמורת הסימפונית חיפה, התזמורת הקאמרית של וינה, התזמורת הקאמרית של לוזאן, התזמורת הסימפונית של אוסטריה התחתונה, התזמורת הסימפונית של בוכום ועוד.
בשנת 2002 מונה למנצחה הראשי של תזמורת סימפונט רעננה ולאחר מכן גם למנהלה המוסיקלי.
בתחום האופראי ניצח על הפקות בבית האופרה של פירנצה ("החטיפה מההרמון" מאת מוצרט, "מקבת" ו"הטרובדור" מאת ורדי, "ג'אני סקיקי" מאת פוצ'יני, "המסע לריימס" מאת רוסיני), בית האופרה של מדריד ("סינדרלה" מאת רוסיני, "הוולקיריה" מאת וגנר), האופרה הישראלית החדשה ("פידליו" מאת בטהובן, "מאנון לסקו" מאת פוצ'יני), התאטרון הלאומי החדש של טוקיו ("הספר מסבילייה" מאת רוסיני), ובית האופרה של לוזאן ("כובע הקש מפירנצה" מאת נינו רוטה).
כמו כן ניצח על האופרה "יומנה של אנה פרנק" מאת ג. פריד, עם הסולנית הישראלית ענת אפרתי בפסטיבל ברגנץ, אוסטריה, וכן באקספו 2000 בהאנובר, גרמניה, (הפקה של בית האופרה הממלכתי של וינה), והוביל את בית האופרה סן קרלו שבנפולי עם היצירה "הטרובדור" לסיורו הראשון ביפן.
הופעתו הראשונה בתאטרון לה-סקאלה במילנו, בהפקת הבלט "מפצח האגוזים" מאת צ'ייקובסקי בעונת 2005 2004, זכתה לשבחים רבים, ולאחרונה ניצח שם, בשנית, על "חלום ליל קיץ" מאת מנדלסון (הופעה שהוקלטה עבור הטלויזיה האיטלקית). בעונת 2008-2007 ערך ניר קברטי הופעת בכורה בצרפת, בתאטרון הקפיטול בטולוז, וכן ניצח , בין היתר, על ערב גאלה לפתיחת תאטרון גרנדה בסנטה ברברה ועל הפקה של ה"טריטיקו" מאת פוצ'יני, במסגרת חגיגות 100 שנה להקמתו של תאטרון קולון בבואנוס איירס.